（1）清政府的伊斯蘭教政策

　　清代前期康熙、雍正、乾隆三朝，國勢興盛。清朝統治者崇奉佛教，尊重道教，入主中原后實際上是以儒家學說施政的，而對于“回教”則是防范多于信任。入關之初，清廷為了鎮懾前明殘余勢力，曾經宣傳過“漢不及回”。但是，當著需要平衡民族關系的時候，清廷便改變調門，大呼“回不及漢”。康熙年間，世有傳言，稱穆斯林“夜聚明散”，意在謀叛?？滴躅C布詔布，予以批駁，說“漢不及回”。雍正元年（公元1723年）、雍正八年（公元1730年）地方官吏奏請朝廷嚴禁回教，革除回俗。雍正痛斥了這些地方官吏的無知和昏庸。但同時認為回民是“甘為異類”的“鄙薄之徒”，“回教原一無所取”。所以雍正的民族政策是“回漢兼抑”。

　　為反抗清朝的階級壓迫和民族歧視，中國穆斯林同全國人民在一起，進行了多次反壓迫起義和斗爭，其中公元1856－1874年由杜文秀領導的云南回族穆斯林起義，公元1862－1877 年的西北回族穆斯林起義、 西北穆斯林起義在一定意義上是清順治五年（公元1648）米喇印、丁國棟領導的“甘州起義”和乾隆四十六年（公元1781）、四十九年（公元1784）蘇四十三、田五反清起義的繼續和發展。這些起義多以伊斯蘭教作為斗爭的思想旗幟和聯絡紐帶，教坊是起義者最基本的組織形式；有的由阿訇或門宦教主領導，禮拜寺為起義隊伍進行斗爭的據點。同時，伊斯蘭教提倡的“舍希德”（即圣戰）精神，鼓舞了他們英勇頑強的斗爭意志。這些起義和斗爭沉重地打擊了清王朝的民族壓迫，但各次起義均被清朝統治者殘酷鎮壓，致使人口銳減，大批穆斯林或被發配邊疆或被遷徙窮山僻壤之地，居住愈來愈分散，生活環境和社會環境更為艱苦，中國穆斯林蒙受厄難。

　　乾隆后期，清政府開始對伊斯蘭教采取高壓政策。籠絡中國伊斯蘭教上層分子，“以回制回”；利用不同教派，破壞和削弱伊斯蘭教；一旦矛盾激化，形成械斗，則堅決地以武力鎮壓，這是貫徹高壓政策的基本策略。終清一代，這一策略沒有太大的變化。

　?。?）教派、門宦

　　自清末民國初，由于社會矛盾和教派矛盾的發展，甘肅東鄉人馬萬福等阿訇，在“尊經革俗”、“憑經行教”的宗旨下，在西北的甘肅、青海和寧夏地區創立伊赫瓦尼派，后來傳至河南、山東、河北和新疆等地區。這是中國伊斯蘭教自明末清初以來繼蘇菲派傳入之后發生的第二次教派分化。經過這兩次分化，形成了近代中國伊斯蘭教派別格局。至1949年，中國伊斯蘭教內部分為格迪目、蘇菲主義門宦（包括虎非耶、戛迪林耶、哲赫林耶、庫布爾耶）、西道堂、伊赫瓦尼派、賽萊菲耶派等派。中國穆斯林大都屬于遜尼派的哈乃斐教法學派。各派別在基本信仰、教義上是相同的，只是在某些教律和修行禮儀細節上有所區別。